分子之心发布MMDesign最新成果

　　10 月 27 日消息，近日，AI 蛋白质设计企业分子之心发布 AI 从头设计平台 MMDesign 最新技术报告，公布其在纳米抗体、大环肽等分子设计领域的实验验证成果。据报告披露，在覆盖 18 个不同靶点的 19 个设计项目中，有 18 个成功获得经实验确认的结合分子，项目成功率达到 94.7%。

　　据介绍，MMDesign 采用“生成—筛选—验证”工作流，通过 AI 生成大量候选分子，再结合结构可靠性、序列天然性及统计物理评估，筛选少量候选进入实验验证。

　　数据显示，19 个项目中，每个项目仅测试 9 至 50 个候选分子，中位数为 21 个。累计 453 个受测候选中，有 139 个获得实验确认，整体候选命中率为 30.7%。其中，15 个项目至少获得两个结合分子。

　　在复杂靶点设计方面，MMDesign 针对六个G蛋白偶联受体（GPCR）靶点开展实验，全部获得确认结合分子。其中，NK3R 靶点的 30 个受测候选全部命中，GPR68 靶点的 11 个候选中有 10 个命中，最优结合分子的解离常数（KD）达到 12.1 纳摩尔。

　　此外，MMDesign 还开展了跨轮次优化实验。在六个此前已获得命中分子的靶点中，五个项目的候选命中率或最佳亲和力得到改善。其中，PDGFR 项目候选命中率由 4.0% 提升至 21.1%，最佳 KD 由 150 纳摩尔优化至 37 纳摩尔。

　　跨分子模态方面，MMDesign 将设计能力拓展至大环肽。在 MDM2 项目中，21 个候选分子有 16 个命中；PD-L1 项目中，28 个候选分子有 11 个命中。

　　底层模型方面，分子之心披露，其自研全原子结构预测模型 MMFold 在 FoldBench 抗体—抗原复合物结构预测基准测试中，针对 172 个抗体—抗原界面的 Top-1 高质量结构预测成功率达到 39.0%，高于报告所列 AlphaFold 3 的 19.8%。

　　分子之心创始人许锦波表示，此次扩展评估的意义在于将一次性设计成功转化为可重复、可扩展的研发能力。

　　目前，MMDesign 已面向制药及生物技术合作伙伴开放合作，MMFold 则已集成至 AI 研发操作系统 MoleculeOS。分子之心表示，未来将继续拓展复杂靶点及分子模态，并加强亲和力与可开发性优化。（易智）